おはようございます！
今日はを質問いただいたので、それに答えますね。
「メールを送るときに、『いつもお世話になっています』という挨拶しか思い浮かばないのですが、別の言葉で、ちょっと気の利いた挨拶はないでしょうか」
この質問がなぜ私に来たのかがわからないんですが（笑）、「こんなのはどうですか？」というのを書いてみますね。
●お礼系
・先日はご足労いただきありがとうございました
・お返事をいただきありがとうございます
・写真（データ）を送っていただきありがとうございます
・昨日は遅くまでありがとうございました
・いつも話を聞いていただき、ありがとうございます
・いつも優しいお心遣いをありがとうございます
●質問系
・毎日暑い（寒い）ですが、いかがお過ごしですか？
・お久しぶりですが、いかがお過ごしでしょうか？
・新しい職場（部署）には慣れましたでしょうか？
・先日お伺いした◯◯のお話はどうなりましたか？
・ご家族みなさまはお元気ですか？
・社のみなさまはお元気ですか？
いつもメールを送る相手と、久しぶりに送る相手とは言葉も違ってくると思いますが、基本的にお礼やねぎらいの質問で送ると失礼はないでしょう。
参考にしてくださいね。
